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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观DNA隔代遗传组组低深浅重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是用较低深浅(~1×)的重测序动态信息对其进行DNA隔代遗传组变种临床诊断,往后采用表观DNA隔代遗传组型注射,将低规格动态信息注射为高规格表观DNA隔代遗传组型动态信息。LcWGS 无须控制系统联合开发,测序费用低,才能修改全表观DNA隔代遗传组组DNA隔代遗传组变种,更极为有立于大企业规模样品的特性准确定位及 GS 生物育种使用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可刷出全染色体组的显性基因遗传变异
  • 高性价比
    以较低的测序料工费低,获取高体积的箭头,测试有效果好
  • 大群体
    样本检测
    可在于大群的dna型查重及调查
  • 分型
    准确性高
    立于安置计算方式,分析精确率led光通量98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS遗传性状品牌定位及GS结果显示相当
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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