产品介绍
由中国国海产品地理学钻研探讨院生物学新技术设备钻研探讨中心的李炯棠钻研探讨队伍联合新技术与济南康普森林业科技单位十分有限单位开发建设新一款适于于鲤培育、明细监定等配用处的人类基因繁育集成电路IC芯片
——“鲤育二号”(图2)。该集成电路IC芯片包涵了20K个高性能量的SNP位点,为桂鱼第三产业提质提效,培育优秀、稳产、耐粗、高抗、耐密等非常好相对性状的桂鱼良种苗能提供强有力的新技术设备作为支撑点。
“鲤育二号”应用康普森CAGT(®)靶向治疗截获测序技木,含带16种主养鳜鱼的全染色体组重测序遗传变异和关键国家经济遗传相对特性有关标示。“鲤育二号”集成块位点重叠全染色体组的选择生物生物育种效果大的位点和包扩很多鳜鱼社会群体多态性标示。该集成块含带鳜鱼健康的品质遗传相对特性(粗核蛋白、粗人体脂肪细胞、碳水化合物、人体脂肪细胞酸、腹肌质构、肌间刺、纹段等)、外周血基本成分及分子式量、姓别等遗传相对特性的分子式标示18056个,于此还包涵识别16种鲤种类特异形位点144个,快速可用于关键遗传相对特性的生物生物育种值估测和种类确权保護。确认样品集成块各种测试,“鲤育二号”集成块,货品位点查出率高,均查出率符合了95.18%,货品保持稳定量分析好、染色体型明确高,相似样品均分几型统一率有98.77%,货品性能方面发芽势。
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好产品企业信息
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至关重要叁数
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“鲤育一號”繁育集成ic
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标志的信息
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箭头型号
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SNP
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标签个数
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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新品种鉴定结论位点
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144
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新技术类形
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康普森CAGT®靶向治疗捉捕测序技术性
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符合人类基因组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。