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业务介绍
乌鳢
乌鳢
产品介绍
中国大水产品养殖科学有效调查院珠江水产品养殖调查所赵建调查员技术团队与天津康普森农林牧科技发展有局限企业联手开拓一堆款适当于乌鳢的靶向疗法驯服选育电源基带集成电路芯片 ——“乌鳢50K选育电源基带集成电路芯片”。该电源基带集成电路芯片含盖了50K个优重量的SNPs位点,覆盖了与怀孕天数相关联的的功能位点,应在乌鳢全染色体组挑选选育、新货种扶植、客户群体家系搭配及系谱司法鉴定等基础框架调查。
货品新信息 重中之重参数设置 乌鳢50K选育电子器件
图标问题 标识种类 SNP
图标人数 50000
宝宝血型有关于位点 230
技术应用类 康普森CAGT®靶向治疗捉捕测序高技术
测序受众 西北、江苏、广东、东莞、湖南、湖南、天津市、哈尔滨市等国家乌鳢包括白乌鳢、金乌鳢
考生基因遗传组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。