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罗氏沼虾
罗氏沼虾
产品介绍
我们鱼业小学科学科学工程院珠江鱼业科学实验所淡水区虾隐性染色体制种全新组于凌云医生科学实验专业团队与广州康普森农林科技创新有局限我司配合,充分通过康普森CAGT®靶点驯服测序技木,的研究開發了包括服务性理论知识土地使用权的罗氏沼虾200K靶点驯服制种集成ic“臻珠2号”。“臻珠2号”包括染色体组铺盖多方面、资金低、结果好、更准率高等教育优点,可技术应用于罗氏沼虾隐性染色体有很多性评估报告、种质信息认定、功用染色体深入挖掘已经染色体组考虑制种等科学实验,而以罗氏沼虾隐性染色体种质信息的開發与充分通过给予多种的氧分子工貝。充分通过“臻珠2号”可繁育罗氏沼虾的最新产品上市种,下一步骤大幅度降低研发资金,为繁育衍生快、抵抗疾病(逆)强、产品质量优秀的罗氏沼虾最新产品上市种打下框架框架。
集成块信息内容 关键所在主要参数 臻珠2号
标记图片的信息 标记符号形式 SNP
符号占比 200000
功效位点 22
测序款式 不一样区域来历的237只罗氏沼虾
表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
应用方向
罗氏沼虾遗传多样性评估
罗氏沼虾种质资源鉴定
罗氏沼虾全基因组选择育种
罗氏沼虾全基因组关联分析
数据表现
研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点,对这些样本开展了高深度重测序工作,最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上,结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点,最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点,这些位点均匀地分布在59条染色体上(图1),并表现出较高的遗传多样性(图2)。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析,结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致(图3),说明该芯片可较好地代表群体原始状况。
图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布
图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布

图3 不同位点集的进化树结果(上图200K,下图所有位点)